Prima di far depositare sul campione il fascio molecolare è necessario che esso sia stato adeguatamente preparato nella camera di preparazione, dal cui oblò è osservabile il campione.

Il suo posizionamento all'interno della camera di crescita viene fatto attraverso la barra di trasferimento (la sbarra di metallo nell'immagine).

Lo studio delle proprietà superficiali del campione viene fatto poi con la tecnica della X-rays Photoemission Spectroscopy (nell'immagine è l'apparato strumentale sulla destra).