L'ambiente della pre-camera è usato per la preparazione e pulizia del campione. Per preparazione si intende la fase di costruzione vera e propria del materiale. Per pulizia, invece si intende la fase di rimozione superficiale di impurezze o di interi strati superficiali con particolari geometrie.

Per reallizare un materiale di buona qualità si ripete il processo di preparazione e pulizia più volte, controllando ad ogni iterazione la struttura del campione in costruzione nella camera di misura utilizzando le tecniche preposte finché non si raggiunge quella desiderata.